有报道指，华大基因在港的华升诊断中心，过去曾经有5个样本经卫生署复检后证实是假阳性。政府回复传媒查询表示，现阶段未有证据显示华大基因及华升诊断中心为政府提供的检测服务质素未达标准。

政府发言人表示，公共卫生化验服务处与私营化验所，以不同平台检测，出现不一致结果，并非罕见，过往偶有发生。若有需要，卫生署会再进一步测试，所有为政府提供检测服务的私营化验所，必须参加及通过卫生防护中心的检测外部质量评估项目，确保检测技术水平质素。

发言人又提到，设于中山纪念公园体育馆的临时气膜实验室，已于8月18日通过外部质量评估项目，确认混样检测的准确性，而华大基因及华升诊断中心分别在6月及7月，就检测设施参加并通过外部质量评估项目。