少量的聚丙烯酰胺絮凝剂不需特殊处理即可排放，因为其pH值、重金属含量不影响环境。但其有较强的絮凝能力，COD较高，少量的聚丙烯酰胺絮凝剂能在自然条件下降解，但量大时，需做特殊处理。有两个简易的方法可供参考：1、在聚丙烯酰胺絮凝剂内加入聚合氯化铝溶液或者反电荷的聚合物（如：反电荷的聚丙烯酰胺），搅拌即可产生大量的絮体，将絮体过滤分离，分离后的滤渣挤干后可作为固废处理，过滤后的溶液粘度降低至接近清水时再排放可减少聚丙烯酰胺对环境的影响。2、在聚丙烯酰胺絮凝剂内加入酸、碱、盐类（如硫酸、氢氧化钠、硫酸钠、氯化钡、硫酸亚铁等），可缩短其降解时间，一般放置一周，即可看到大量沉淀物，过滤分离后，其粘度明显降低，COD被大幅度的降低。