学院1964年开始招收研究生，1981年成为全国第一批具有硕士研究生授权单位。现有“畜牧学”、“兽医学”2个一级博士点，有“动物遗传育种与繁殖”、“动物营养与饲料科学”、“畜产品安全生产与加工工程”、“特种经济动物饲养”4个二级博士点。有“畜牧学”和“兽医学”2个一级学科硕士授予点，有“动物遗传育种与繁殖”、“动物营养与饲料科学”、“特种经济动物饲养”、“水生生物生产学”、“基础兽医学”、“预防兽医学”和“临床兽医学”7个二级学科硕士授予点；同时还拥有农业硕士畜牧领域、兽医硕士2个专业硕士学位授予点。并设有1个畜牧学博士后流动站。学院现有在校博士生、硕士生300余人。