医工交叉创新研究中心成立于2013年11月，前身为西安光机所OCT与生物光子学研发中心，2019年7月更名为医工交叉创新研究中心。依托单位为中国科学院西安光学精密机械研究所。目前中心主任为张镇西教授。

中心面以“健康中国2030”和“中国制造2025”规划为指引，面向关系国计民生的临床医疗需求，充分利用我所光机电特色，以医工交叉联合产学研为特色，坚持技术创新，反哺光机所医工学科建设。中心致力于填补西部乃至国内外医学仪器空白，研发出一批技术领先、可转化、可应用的科技成果，让科技成果走出实验室，大力发展其在临床医学领域的各项应用。

近年来，围绕上述研究方向，中心承担国家科技支撑计划项目1项，中科院STS项目1项，陕西省科技计划2项，经费总额340万余元，申请国家发明专利10余项；产出SCI论文3篇、EI论文8篇，培养硕士研究生5人，整体形成一定的研究特色和影响力。

此外，中心与西安交通大学、西安电子科技大学、第四军医大学、西安国际医学中心，及美国、荷兰、香港等著名大学和研究机构保持了长期和实质性的合作研究，形成了集前沿技术研究与应用成果转化、医工交叉融合为一体的创新体制科研平台。