《寺庙台账》记载：“玉渠宫乃是清乾隆初年由福建省泉州府晋江县石厦乡分香来台，光绪廿三年（1897）遭暴风雨吹毁，光绪廿九年（1903）由施清河倡议建，同年五月完工。”
乾隆卅年(1765)建祠奉祀。并于清光绪廿九年(1903)由仕绅施清河倡议重建，施妈质慷慨献地，四方善士一呼百应，踊跃捐资鸠工兴建，同年五月完工。
民国五十四年(1965)炉主粘文氏倡议重修，经施国栋、庄瑞经、张水鄂、施水龙、施得意等成立玉渠宫重修委员会，自民国五十五年炉主庄明盘、民国五十六年炉主施水秀暨各界之响应，推诚乐捐，于民国五十六年(1967)动土兴建，并将庙基垫高二尺，中梁升二尺六寸，同年六月殿宇完成，庙貌焕然一新。民国五十六年(1967)完成重修后，于民国六十年(1971)举行祈安三献庆典。
宫前并非是两座石狮坐镇，非常特殊的点是以“金鸡”、“银犬”相伴。
寺庙彩绘首度出现卡通明-哆啦A梦、米老鼠、星派大兴海绵宝宝等。