民国26年（1937）卢沟桥事件爆发后，为因应战时军事整合作战之整体需求，并配合国防军事优先的前提，中国国民党中央政治委员会8月11日第五十一次会议，决定设立国防最高会议，作为全国国防最高决定机关，于8月14日正式成立。该会设主席、副主席各一人，以国民政府军事委员会委员长为主席，中国国民党中央政治委员会主席为副主席，此两职位分别由蒋中正与汪精卫担任。

在训政期间作为党政最高指导单位的中央政治委员会，因战争缘故，而无法定期召开会议，在战时军事为重的前提下，于11月通过〈非常时期中央党政军机构调整及人员疏散办法〉，暂停中央政治委员会职权暂停，交由国防最高会议代行之，成为战时政治、军事最高决策机构。对于抗战初期之国家发展及军事战略之制定执行，发挥关键性作用。

国防最高会议至民国28年（1939）1月，中国国民党在五届五中全会上，因强化统合党、政、军三方之作战配合，决定在国防最高会议的基础下，设置国防最高委员会，以取代国防最高会议。