生态学主要探讨生物与生物，和生物与环境之间的关系。人类社会的各种开发行为对生态与环境造成严重干扰，导致环境品质低落与生物多样性的急遽减损。近年来环境保护与生态保育已成为世界各国国家发展，以及确保国民生活品质的重要目标。

国立台南大学生态暨环境资源学系成立于2008年，为国内唯一以生态学理论与实务应用为教学与研究主轴的科系，具有特色与前瞻性。本系包括大学部，以及环境生态与生态旅游两个硕士班。本校开发中的七股校区位于生物资源丰富的滨海地区以及渔村，邻近的河口与滨海湿地提供学生可以实际操作的独特学习环境，可以进行湿地生态、鸟类、鱼类、昆虫、两栖动物、植物等，以及生态复育、社区总体营造的教学与研究，并提供生态旅游硕士班学生进行生态旅游资源调查、生态旅游规划、与导览解说之实务训练。