运筹与控制系成立于2009年9月。该系设有运筹学与控制论专业硕士点、博士点以及博士后科研流动站。共有五个研究方向：非线性偏微分方程理论、分布参数系统控制理论、集中参数系统控制理论、随机系统控制理论和偏微分方程的逆问题。
运筹与控制系现有教师10人，其中教授（博士生导师）3人，副教授4人，讲师3人，9人拥有博士学位。1人为长春市有突出贡献专家（高夯教授）；1人为全国优秀博士学位论文提名论文指导导师（张凯军教授）；1人入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”；1人获“关肇直奖”。
该系教师毕业于中国科学院数学与系统科学研究院、复旦大学、山东大学、浙江大学和东京大学等国内外知名高校和科研机构。形成了以中年教师为核心，青年教师为主力，年龄结构合理的一支学术梯队。该梯队成员学术思想活跃、学术视野开阔。与美国明尼苏达大学、美国俄亥俄大学、法国巴黎第六大学、罗马尼亚亚西大学、日本东京大学、香港城市大学和香港中文大学同行保持密切的学术合作与交流。
该系教师在近五年共主持了6项国家自然科学基金面上项目，4项国家自然科学基金青年项目，2项数学天元基金项目，1项教育部“新世纪优秀人才支持计划”项目；并参加了一项“973计划”项目。