2017年举办的首届北京通州运河半程马拉松为北京城市副中心马拉松的前身，在办赛元年获得“中国田径协会铜牌赛事”和“自然生态特色赛事”称号。2018年获得“中国田径协会银牌赛事”和“自然生态特色赛事”称号。2019年赛事升级为“中国田径协会金牌赛事”，已成为北京传统体育赛事及国内知名马拉松赛事。升级为全马赛事之后的2021北京城市副中心马拉松，以展现“古今同辉、蓝绿交织、水城共融，绿色生态”的通州风貌为主题，赛道穿越北京市政府行政办公区、城市绿心公园、大运河森林公园、燃灯塔及三教庙等地标性建筑，全方位展现了通州区生态文明建设成果。