从前从前，天空有着白之王国，地上有着黑暗王国。两个王国保持〈均衡〉的同时不断〈循环〉著。某天，有名少年在黑暗王国中某个被魔兽摧毁的村庄里挖著坟墓。 此时，前任黑暗之王的继任者“史奇亚兹”出现在那名少年面前。被“史奇亚兹”看上的少年就这样成了暗之王子，并下定决心要改变这个世界。另一方面，白之王国的守护神──光明之王“爱莉丝”则在担心光与暗的均衡被打破一事。就在这时，传来扰乱均衡的存在“巴尔”现身的消息。黑暗王国的黑暗之王为了讨伐碍眼的“巴尔”，向白之王国提出了结盟的邀请。光明之王艾莉丝与作为使者从黑暗王国前来的暗之王子会面，并缔结了要一同创造和平世界的〈约定〉。然而，黑暗之王却破坏了两人所交换的〈约定〉。两人的〈约定〉以及毁灭世界原罪。通往〈根源〉(零)的故事就此展开——