过往的所有文章都可以在文章索引页面查看。GWAS中的赢家诅咒是指遗传效应的大小由于GWAS中的筛选过程(通过全基因组显著阈值筛选lead SNP)而被系统性地过高估计。
赢家诅咒本用来指代在拍卖中类似的现象。即使一件拍卖品对所有买家来说都有相同的价值(出价是无偏的),最后拍得物品的赢家很可能过高估计了拍卖偏的内在价值。类比于GWAS,lead SNP即为赢家,而它的效应量可能过高估计了真实的遗传效应。
在通过阈值筛选的情况下, 的近似抽样分布(实际上为一个截断正态分布 truncated normal distribution)为:
从以上的近似抽样分布可以得到,筛选出来的SNP的效应量的期望分布为:
用这个式子便可以对效应量进行赢家诅咒的校正。
可以使用这个R包进行赢家诅咒的校正。
