实验室净化区的空调是一个巨大的能源消耗，在实验室的规划和装修中应注意节能措施。在实验室规划中，系统和区域的划分、送风量的计算、温度和相对温度的确定、净化水平和通风频率的确定、新风比、风管的保温、风管生产中的通风方法对漏风率的影响，主管和支管的连接点对气流阻力的影响、法兰连接的泄漏以及空调箱、风机、冷却器和其他设备的选择都与能耗密切相关，必须考虑这些细节。空调机房应紧靠洁净室，既能节约能源，又有利于风管的布置，使配风更加合理，节约工程成本。
现在，许多实验室装修公司使用手动方法来控制风量和空气压力。但是，由于用于控制风量和气压的调节阀具有技能隔板，且天花板也是彩色钢板制成的软天花板，因此在设备调试期间基本上进行了调整，因此不会进行调整。为保证洁净厂房的正常运行，应设置一套相对完整的自动控制设备，包括以下几个方面：洁净室的空气洁净度、温度和湿度、压差监测和空气阀调节；检测高纯气体、纯水和循环冷却水的温度、压力和流量；监测气体纯度和纯水质量等。这些监测设备可规划为单个系统控制系统或分布式计算机控制和管理系统。