但同时有 中国护照+美国护照+香港护照 就变成“合法”的了？
Good point. 中国很多法律确实是漏洞百出，比如国籍法和出入境管理条例允许一个人同时是大陆居民和香港永久居民(比如孟晚舟)，同时国籍法在香港的司法解释也允许香港居民同时持有外国国籍(中方单方面不承认而已)，却不允许大陆居民持有外国国籍。相当于法律不允许你从北京去河北，却允许你从北京去天津，同时也可以从天津去河北。
蓝本值机，航司要查中国签证的时候拿出红本，
你自己应该从来没尝试过吧。事实是，航司会把你的蓝本扔回来，让你直接用红本值机。中国大陆也用API，航司需要在起飞前把值机旅客名单发给中国边检，让一个没有中国签证的"美国"旅客登机航司会被中国边检罚的。