新医院位于屏东市大连路原有院址上，依据本所之规划报告拟定分期发展计划。扩建第一期工程约150床，计有门诊等10科，依规划报告之建议，本工程主要为门诊大楼及部分病房，而二期扩建始为主要病房大楼，故在空间量体及动线安排上均朝此一目标进行设计。

基督教医院在台湾，尤其在屏东多以服务中低收入之原住民同胞为主，故在整体空间之处理上，着重经济性的造价效益，乃保养之简易度等，但亦期塑造一现代化医院之前瞻形象，以俾造福更多当地民众。本工程为地下一层，地上六层之建物，总楼地板面积约9500平方米，总工程造价约168000000元，于1989年9月竣工。