因为蚯蚓粪所含营养元素多种多样，并且能显著提升土壤层中微生物总数，改进土壤质地。很多年的实验说明，在持续应用蚯蚓粪微生物有机肥料后，可使重茬不产量下降，针对甘薯农作物乃至生产量1年比1年高，但是必须留意的是蚯蚓粪微生物有机肥料应用常见注意事项：
①蚯蚓粪微生物有机肥料应尽量避免应用新颖的，并且尽量是历经短期内发酵的，发酵可使在其中不够腐熟的粪料完全熟成，使有益微生物繁衍越来越多，肥力也会高些。蚯蚓粪不适合储存太久，不然肥力会显著降底。
②蚯蚓粪微生物有机肥料虽营养成分全面性，但养分含量稍显不够，因此与无机肥料相互配合应用实际效果更优，但不适合与速溶性化肥掺混应用。除此之外，蚯蚓粪的土地改良实际效果是较慢的，假如土壤层问题比较严重，依然提议使用有机物种刺激剂(淋根型)给以改进。
③蚯蚓粪微生物有机肥料不适合暴晒和温度高晒干，温度高使微生物活性降底。
④因蚯蚓粪微生物有机肥料中带有越来越多有益微生物，因此蚯蚓粪不适合与农药杀菌剂相互配合应用。
⑤蚯蚓粪微生物有机肥料所配备的乳浊液对病虫害 防治效果不太平稳，病虫害 高发时，该使用药物使用药物，切忌耽搁预防工作。