神盾局在经历了与异人族之间的战争之后，激发异人的元素不慎扩散到了全世界，而如今获得异能控制能力的黛西／丝凯开始积极找寻世界各地进化成异人的人类，并设法协助他们学会控制能力并保护他们。但全世界自从经历了多个外星灾难之后开始对外星生物感到极度恐慌，而由政府创立的新行动小组“高级威胁控制组”却每次都抢先一步找到他们。当考森试图与小组的领导人沟通时，意外得知他们每次找到的顶多只是尸体，于是两方怀疑在他们之间还有另外一伙人马在从中作乱。而一波未平、一波又起，群龙无首的“九头蛇”在沃德的组建下开始另起炉灶，考森不仅要负责调查外星文明来调查异人族，也要试图救出被困在“另外一端”的一分子，甚至世界也再度对神盾局失去了信心。