武汉大学朱玉贤团队与美国农业部农业科学研究院南方平原试验中心John Z. Yu等研究人员,合作揭示了棉花基因组的进化历程。
该项研究成果于2020年4月13日在线发表于 《自然—遗传学》。
在组装了第一个药棉(A1)基因组并显着改善了现有的树棉(A2)和陆地棉((AD)1)基因组后,研究人员证明了所有现有的A基因组都可能起源于一个共同的祖先。
A0与A1在系统发育上的相关性高于A2。
此外,结果显示出异源四倍体形成先于A1和A2的形成。两种A基因组都是独立进化的,并没有祖先与后代的关系。
高斯概率密度函数分析表明,从570万年前至61万年前发生了数个长末端重复的爆发,对A基因组大小的扩展、物种形成和进化产生了显著贡献。
基因区域中丰富的物种特异性结构变异改变了许多重要基因的表达,这可能导致(AD)1中纤维细胞的改善。
这些发现解决了围绕A基因组起源的现有争议概念,并为棉花遗传改良提供了宝贵的基因组资源。
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编辑 | 余 荷返回搜狐,查看更多
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