棉籽的作用是温肾、补虚、止血。临床上可通过棉籽汤口服，或制成药丸、药粉或开水熏蒸治疗与身体有关的疾病。尤其对于男性性功能障碍，如男性阳痿、早泄，可以很好的治疗。对于男性睾丸出现脱落，效果也不错。对于脱垂以及痔疮，可以辅助治疗。棉籽还可用于治疗女性疾病，如女性子宫出血和白带，这是治疗的范围。棉籽可与其他药物合用，治疗儿童哺乳期乳汁分泌和尿床，可以治疗。